山东第一医科大学（山东省医学科学院）档案馆（校史馆）成立于2020年6月，由原泰山医学院档案馆、校史馆，山东省医学科学院综合档案室整合而成。在主校区、长城路校区分别建有档案馆、校史馆。

主校区档案馆建筑面积约1470平方米，其中库房面积约900平方米，于2020年底投入使用，现有馆藏约5.5万卷件，主要为原山东省医学科学院及山东第一医科大学（山东省医学科学院）档案；长城路校区档案馆建筑面积744平方米，库房面积424平方米，现有馆藏约3万余卷，主要为原泰山医学院档案。

校史馆建筑总面积6127平方米，主校区校史馆建筑面积4927平方米，展览面积3580平方米，2023年9月开馆对外开放；长城路校区校史馆1200平方米，2014年初建，2020年9月完成升级改造对外开放。

档案馆（校史馆）致力于打造一个安全、舒适、开放的档案管理利用与校史价值提升环境。先后完成4个库房的基础建设，设立档案整理室、数字化室、利用室，建设了安防智能一体化监控系统、档案综合管理系统、远程查档利用系统、年鉴编纂系统等。围绕校史馆建设，坚持以“记录历史、传承文化、弘扬精神、启迪未来”为使命，深入挖掘校（院）历史文化遗产，全面研究校（院）发展历程和文化底蕴，通过整理校史资料，收集、整理和展示校（院）历史文物，推广校史文化，传承和弘扬校（院）的文化底蕴和品牌形象，为校（院）发展贡献力量。